马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。
您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册
x
本帖最后由 青菜567 于 2023-9-28 10:41 编辑
/ T2 V$ F: r8 |8 a% D6 Q+ S7 k. [2 T& L- f A2 r$ h9 l
无论就医看病还是体检,做的检查除了仪器检查如B超、CT、核磁共振、胃肠镜外,最多的就是生化检查,如基于血液、尿液、大便、痰液等的检测,因为这些体液中含有众多生物标志物,能够提供关于健康状况和疾病风险的重要信息。
2 h9 b0 r4 ]* g, b$ U! ]5 T& N, @ $ V$ s8 p* l5 U# O; N" T
以血液为例,血液是流动在人的血管和心脏中的一种红色不透明的粘稠液体,负责各类营养物质的输送以及机体产生的废物的排除。血液由血浆和血细胞组成。血浆中含有水、蛋白质和其他溶解物质,血细胞包括红细胞、白细胞和血小板。 ( @& K2 Z d: P$ t1 k# D
血液中一些指标的异常时常预示着身体某个器官或组织机能受损。目前基于血液的肿瘤早筛技术中经常提到的cfDNA就是血浆中存在的一种分子标志物。
$ J. m* W# \! [+ \/ D
(参考于网络图片). O' W U% |8 }1 I9 ]& }
4 e5 o+ z/ a; Y' e如何理解cfDNA和ctDNA?
" x8 f) `% e( z1 acfDNA全称为cell free DNA即细胞游离DNA,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。那么问题来了,DNA不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢? ' t4 g R( E' `! \2 ~4 Q
人体内的细胞不断更新换代,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡,又有新的细胞在形成。在细胞凋亡过程中有些DNA会“破壳而出”进入血液中,另外,人体在外界物理或化学刺激下引发的细胞坏死也会导致DNA释放到血液中,所以我们人体血液中都含有cfDNA。
, x r4 y) c: M4 Y; [. ?7 j
(参考于网络图片) 0 @# a: g( x; G2 j) G a+ r! Z
但对于肿瘤患者来说,其血液中除了含有正常细胞凋亡或坏死释放的DNA外,还包括肿瘤细胞释放的DNA,这部分DNA有个专有名称叫ctDNA,全称为circulating tumor DNA即循环肿瘤DNA。因此对于肿瘤患者来说,血液中的cfDNA包含了ctDNA。 3 z3 _( j# V- _! u* E! ]* G+ b7 P
ctDNA主要来源于坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞、循环肿瘤细胞(CTC)、肿瘤细胞分泌的外排体,其携带与肿瘤发生相关的分子信号,这些分子信号如同肿瘤的“身份指纹”,对肿瘤早筛、肿瘤精准治疗都具有非常重要的意义。 4 T @' V( C- x: ^# C
cfDNA全基因组测序肿瘤早筛技术 # i: W& s' j5 ?
通过上面我们了解了cfDNA和ctDNA的概念和区别,那么对于肿瘤早筛来说,到底检测的是cfDNA上的哪些信息?也就是哪些信息是与肿瘤的早期发生相关呢?这个需要经过临床研究进行标志物的筛选和验证。
( t9 W( i# k4 z7 _! B" z
和瑞基因研发团队通过临床研究发现,仅需受检者10ml静脉血,通过全基因组测序技术(WGS, Whole Genome Sequencing)和自主研发的机器学习算法,在全基因组范围内分析四个维度的特征提取及模型构建,包括末端序列、片段大小分布、核小体印迹、拷贝数变异,可精准评估六大高发高危癌种风险,包括肺癌及五大消化系统癌种(食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌),并可准确溯源癌症风险器官。 ( ]5 S4 a& ?6 V7 E
那么如何理解四个维度呢?
1 Y/ _- \4 t& u( F片段大小
6 J5 ~: U& A8 y- x( S( C0 m7 i" `* h: l+ d6 {+ W+ d2 S' p
DNA片段大小以核苷酸碱基对的数量表示,以bp为单位。肿瘤细胞释放的ctDNA片段大小比正常细胞释放的cfDNA更短。 1 e) `. Z3 s* O; N
末端序列
) ~) Z2 Q/ A( C& t5 f! L在DNA片段化进入血液过程中,DNA发生了非随机断裂,其末端的几个核苷酸,癌与非癌具有不同偏好的末端切割模式。
- p4 c9 F( l" | j* |- W % C4 }7 s2 b4 e' V8 ~( C9 Y1 s
核小体印迹
* |3 l Z4 v8 N- ~% ^' C2 X1 t$ J P' T! y9 J! K
肿瘤发生和发展的内因是原癌基因的活化和/或抑癌基因的失活等异常表达,而核小体印迹的松散程度可代表基因表达活跃程度的高低。
- g9 P$ z$ B. O z' q7 W 拷贝数变异
. `* R; ]" _! y( c- g% k
$ o( o1 W+ H; Q& H' v' a肿瘤组织通常存在拷贝数变异等染色体异常现象,而正常组织基本无此现象。 , R7 [+ E m% R4 Y4 l; s' s
(可点击图片放大查看) - ]( ^+ B2 t0 T7 _* x& `- b1 m
& b: s6 \1 A7 B& K+ o7 G1 K; Z# I! R8 O( s
|